โรงเรียนบ้านซับไทรทอง ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 10 ตุลาคม 2528 โดยใช้ชื่อว่า “โรงเรียนบ้าน โคกสันติสุข สาขาซับไทรทอง” โดยความร่วมมือของประชาชนในหมู่บ้านช่วยกันบริจาคที่ดินและวัสดุ ก่อสร้างอาคารเรียนชั่วคราวขึ้น 1 หลัง โดยเปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 – 4 มีนักเรียน 65 คน ครูช่วยราชการ 1 คน คือ นายณรงค์ มณฑาศรี ต่อมาปีพ.ศ. 2530 ชาวบ้านและโรงเรียนพิจารณาเห็นว่าสถานที่ตั้งของโรงเรียนไม่เหมาะสม จึงร่วมกันบริจาค เงินจำนวน 8,600 บาท ซื้อที่ดินของ นายยวน เลาะสันเทียะ จำนวน 12 ไร่ 75 ตารางวา และย้ายโรงเรียนมาตั้งที่แห่งใหม่ ซึ่งเป็นที่ตั้งในปัจจุบัน และปัจจุบันบริหารงานโดย นางลภาภัทร พลสิทธิ์ ผู้อำนวยการสถานศึกษาวิทยฐานะผู้อำนวยการชำนาญการพิเศษ มีนักเรียน 125 คน ข้าราชการครู 7 คน พนักงานราชการ 1 คน ชางครุภัณฑ์ 3 1 คน