โรงเรียนบ้านหนองบัวแดง จัดตั้งขึ้นเมื่อวันที่ ๒๔ เมษายน ๒๔๘๗ นายอำเภอเซกาในขณะนั้นเป็นผู้จัดตั้งโดยมีนายณรงค์ อ่อนคำตัน เป็นครูใหญ่คนแรก เปิดสอนตั้งแต่ระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑ – ๔   มีนักเรียนจากบ้านหนองหิ้งและบ้านโพธิ์น้อยมาเรียนร่วม โดยมีนักเรียนรวมทั้งหมด ๘๐ คน ในปี พ.ศ. ๒๕๐๒นักเรียนจากบ้านหนองหิ้งได้แยกไปเรียนที่โรงเรียนบ้านหนองหิ้ง และต่อมาในปี พ.ศ. ๒๕๑๐ นักเรียนจากบ้านโพธิ์น้อยได้แยกออกไปเรียนที่โรงเรียนบ้านโพธิ์น้อย ปัจจุบันโรงเรียนบ้านหนองบัวแดง สังกัด สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาบึงกาฬ สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ เปิดทำการสอน ๒ ระดับ คือ ระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษา