โรงเรียนบ้านนาคำนาใน จัดการศึกษาเพื่อพัฒนานักเรียนให้มีคุณภาพตามมาตรฐานของหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน มีคุณธรรมจริยธรรม บุคลากร จัดกระบวนการเรียนรู่ที่ยึดนักเรียนเป็นสำคัญ ชุมชนมีส่วนร่วมในการจัดการศึกษา