โรงเรียนบ้านหนองขามปัจจุบันตั้งอยู่ที่ หมู่  2   ต.ทุ่งขวาง  อ. กำแพงแสน  จ.นครปฐม 73140  ในระยะแรกเริ่ม ประมาณปี พ.ศ.2493 โรงเรียนบ้านหนองขามนั้นมิได้อยู่ ณ ที่ตั้งปัจจุบัน แต่ถูกสร้างขึ้นบริเวณด้านทิศตะวันออกเฉียงเหนือ ของหมู่บ้านซึ่งห่างจากหมู่บ้านหนองขามใหญ่ ประมาณ 2 กิโลเมตร และห่างจากหมู่บ้านหนองขามเล็ก หมู่ 9 ต.ทุ่งกระพังโหม อ. กำแพงแสน จ.นครปฐม ไปทางเหนือประมาณ 2 กิโลเมตรเศษ   หลังจากนั้น 10 ปี คือ ปี พ.ศ.2493  ก็ได้ถูกยุบไปเรียนรวมกับโรงเรียนบ้านดอนซากอยู่พักหนึ่ง  ซึ่งห่างไกลออกไปอีก กว่า 3  กิโลเมตร ซึ่งชาวบ้านส่วนใหญ่เห็นว่าไม่สะดวกในการส่งบุตรหลานเข้ารับการศึกษา

               ดังนั้นในปี พ.ศ.2503  นายโจ่ย   หนองขามทอง และ นางสาย   แก่นแก้ว ได้ร่วมกันบริจาคที่ดินบริเวณใกล้กับหมู่บ้าน บริเวณหมู่ 2 ต.ทุ่งขวาง อ.กำแพงแสน จ.นครปฐม   ณ ที่ตั้งปัจจุบัน ซึ่งชาวบ้านหนองขามได้พร้อมกันบริจาคทรัพย์สิน และอุปกรณ์   มูลค่า 50,000 บาทเศษ  สร้างอาคารหลังแรกขึ้น     เปิดสอนชั้นประถมศึกษาปีที่1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 โดยมีนายสานิตย์  แก่นแก้ว  เป็นครูใหญ่คนแรก และต่อมาได้มีการก่อสร้างอาคารเรียน อาคารประกอบต่างๆ ผู้บริหารคนปัจจุบัน คือนางปิยนันท์  ทั่งปราณี