โรงเรียนบ้านไหนหนังก่อสร้างเมื่อ พ.ศ. ๒๕๐๗ เปิดทำการสอนเมื่อวันที่ ๑๘ พฤษภาคม ๒๕๐๘ มีอาคารเรียนขนาด ๙ x ๑๘ เมตร จำนวน ๑ หลัง จำนวน ๒ ห้องเรียน มีนักเรียนเข้ารับการศึกษาวันแรก ชาย ๓๓ คน หญิง ๒๙ คน รวม ๖๒ คน นายปลอง เอียดเอื้อ ศึกษาธิการอำเภอเมืองกระบี่เป็นประธานในพิธีเปิดเรียนปฐมฤกษ์ โดยมีนายวัน เนื้อนุ้ย เป็นครูใหญ่ เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑ มีครูเพียงคนเดียวต่อมาได้ครูเพิ่มอีก ๑ คน คือนายดรุณ หูล่อง (ภิญโญรัตนโชติ) ย้ายสถานที่ตั้งโรงเรียนจากข้างมัสยิดบ้านไหนหนังมาใช้สถานที่ในปัจจุบัน และมีการปรับเปลี่ยนหลักสูตรประถมศึกษา ๒๕๐๓ มาเป็นหลักสูตรประถมศึกษา ๒๕๒๑ จนปัจจุบันใช้หลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พ.ศ. ๒๕๔๔ เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาลปีที่ ๑ ถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๓